Vinkkejä tiedoston BED avaamiseen
BED-tiedostoa ei voi avata? Et ole ainoa. Tuhannet käyttäjät kohtaavat samanlaisia ongelmia päivittäin. Alla on vinkkejä BED-tiedostojen avaamiseen sekä luettelo ohjelmista, jotka tukevat BED-tiedostoa.
BED-tiedostotunniste
| Tiedoston nimi |
UCSC BED Annotation Track Format |
| File Developer |
UCSC |
| Tiedostoluokka |
Data Files |
BED-tiedostoa tuetaan 4-käyttöjärjestelmässä. Käyttöjärjestelmäsi mukaan saatat tarvita eri ohjelmistoja BED-tiedostojen käsittelemiseen. Alla on yhteenveto ohjelmien määrästä, jotka tukevat ja avaavat BED-tiedoston kullakin järjestelmäalustalla.
Mikä on BED-tiedosto?
Tiedosto, jonka tunniste on BED, on Data Files-tiedostotyyppi. Tämän muodon kirjoittaja on UCSC. Data Files koostuu 1326 vastaavasta tiedostosta. UCSC BED Annotation Track Format: ää tukee 4-käyttöjärjestelmä. Tiedosto toimii Linux, Mac OS, Web, Windows-järjestelmissä, valitettavasti ei muissa. Tärkein ohjelma, joka tukee tätä muotoa, on Integrated Genome Browser. Tämän loi UNC Charlotte. Vaihtoehtoisesti voit käyttää 4 muuta ohjelmaa. Genome Browser, InfoSnorkel-ohjelmat käsittelevät tiedostoa myös silloin, kun Integrated Genome Browser-ohjelma ei täytä rooliaan.
Kuinka avata BED-tiedosto?
Yleisin ongelma käytettäessä UCSC BED Annotation Track Format on, että tiettyä BED: ta ei ole liitetty ohjelmaan. Tämä aiheuttaa tiedoston BED avaamisen järjestelmäsovelluksissa, joita ei ole tarkoitettu tähän tarkoitukseen, tai näyttää viestin, että siihen ei ole liitetty ohjelmaa. Tämä ongelma voidaan korjata helposti.
Ensimmäinen asia, jonka sinun pitäisi tehdä, on vain kaksoisnapsauttaa avattavaa BED-tiedostokuvaketta. Jos käyttöjärjestelmällä on asianmukainen sovellus sen tukemiseksi ja tiedoston ja ohjelman välillä on myös yhteys, tiedosto on avattava.
Vaihe 1. Asenna Integrated Genome Browser
Tässä tapauksessa sinun on ensin tarkistettava, että Integrated Genome Browser-sovellus on asennettu tietokoneeseen. Tätä varten kirjoita nimi Integrated Genome Browser järjestelmän hakukoneeseen. Jos näin ei ole, asennus voi ratkaista ongelman, koska useimmat sovellukset luovat tiedostoyhdistelmiä asennuksen aikana. Alla on luettelo ohjelmista, jotka tukevat tiedostoa BED.
Ohjelmat avaamaan BED-tiedosto
Muista ladata BED-tiedostoa tukevat ohjelmat vain tarkistetuista ja turvallisista lähteistä. Suosittelemme käyttämään ohjelmistokehittäjien verkkosivustoja.
Vaihe 2. Luo Integrated Genome Browser yhdistäminen BED-tiedostoon
Jos BED-tiedosto ei käynnisty asennetusta sovelluksesta huolimatta Integrated Genome Browser-sovelluksessa, sinun on luotava tiedostoyhdistelmä. On kätevintä soittaa pikavalikkoon hiiren oikealla painikkeella ja valita Ominaisuudet. Ikkuna näyttää muun muassa tiedoston tyypin ja tiedot, joiden avulla ohjelmaa käytetään tiedoston käynnistämiseen. "Muuta" -painikkeella voimme valita haluamasi ohjelman. Ohjelman pitäisi olla näkyvissä ikkunassa, muuten se on valittava manuaalisesti "Selaa" -painikkeella ja ilmoitettava ohjelman asennushakemisto. On kuitenkin tärkeää tarkistaa "Käytä aina valittua ohjelmaa ..." -ruutu, jolloin voit liittää BED-tiedoston pysyvästi Integrated Genome Browser-sovellukseen.
Vaihe 3. Päivitä Integrated Genome Browser uusimpaan versioon
Vika voi olla myös Integrated Genome Browser-ohjelmassa, on mahdollista, että UCSC BED Annotation Track Format vaatii uudemman version ohjelmasta. Tämä voidaan tehdä sovelluksella (jos se tarjoaa tällaisia vaihtoehtoja) tai UNC Charlotte-sivustolta ja asenna uusin versio.
Vaihe 4. Tarkista seuraavat ongelmat BED-tiedostossa
Jos yllä olevat vaiheet eivät auta, voit olettaa, että itse tiedosto ei ole oikea. Tiedosto-ongelmat voidaan jakaa seuraaviin:
Kyseinen tiedosto voi olla 0 kt tai odotettua pienempi. Tämä johtuu useimmiten ongelmasta ladattaessa BED-tiedostoa. Tiedosto tulee ladata uudelleen varmistaen, että prosessi on päättynyt oikein.
Käyttöjärjestelmä voi olla tietokonevirus. Ajantasaisella virustentorjuntaohjelmalla suoritettavan virustarkistuksen pitäisi korjata ongelma. Jotkut virustentorjuntatoimittajat tarjoavat myös ilmaisia online-skannereita. Parhaan tuloksen saamiseksi skannaamme koko käyttöjärjestelmän, ei vain BED-tiedostoa. Skannauksen seurauksena joskus ei ole mahdollista palauttaa BED-tiedostoa, jotka poistetaan, jos tiedostosta on varmuuskopio, ja sen palauttamisen jälkeen se on myös tarkistettava.
Tämä voi tapahtua varsinkin kun ohjelmaa kehitetään dynaamisesti ja BED-tiedostojen rakenne muuttuu ajan myötä. Nämä ongelmat ovat tunnettuja ja ne on usein helppo korjata ohjelmistokehittäjien verkkosivuilla.
Tähän voi olla monia syitä. Korjaus riippuu suuresti tiedostotyypistä. Jotkut ohjelmat tarjoavat mahdollisuuden palauttaa tiedot vahingoittuneista BED-tiedostoista. Helpoin tapa on palauttaa tiedosto varmuuskopiosta, jos sellainen on, tai ota yhteyttä UCSC
Kun luet, näyttöön tulee viesti, että tiedosto on salattu tai vioittunut. Salattuja BED-tiedostoja voi käyttää laite, jolla ne salattiin. Missä tahansa muussa laitteessa vaaditaan asianmukainen salausavain ja salauksen purku ennen sen palauttamista.
Käyttöjärjestelmä suojaa tiedostoja joissakin sijainneissa (esim. Järjestelmäosion juuri) luvattomalta käytöltä. Vaikka tällaisen tiedoston lukemisessa ei yleensä ole ongelmaa, sitä ei ehkä voida tallentaa. Jos mahdollista, voit yrittää siirtää BED-tiedoston toiseen sijaintiin.
Tämä ongelma ilmenee vain monimutkaisemmissa tiedostoissa. Jotkin tiedostotyypit voidaan avata vain yhdessä ohjelmassa kerrallaan. Muiden ohjelmien sulkemisesta pitäisi olla apua. Joskus joudut odottamaan istunnon sulkemista tiedostoon BED. Jotkin taustaohjelmat voivat kuitenkin estää BED-tiedoston skannauksen aikana. Jos ongelma ei poistu, käynnistä kone uudelleen.
Oliko tämä sivu avuksi? JooEi
