Conseils pour ouvrir le fichier BED

Impossible d'ouvrir le fichier BED? Tu n'es pas le seul. Des milliers d'utilisateurs sont confrontés quotidiennement à des problèmes similaires. Vous trouverez ci-dessous des conseils sur la façon d'ouvrir les fichiers BED ainsi qu'une liste des programmes prenant en charge les fichiers BED.

Extension de fichier BED

Nom de fichier UCSC BED Annotation Track Format
Développeur de fichiers UCSC
Catégorie de fichier Fichiers de données

Le fichier BED est pris en charge sur les systèmes d'exploitation 4. En fonction de votre système d'exploitation, vous aurez peut-être besoin d'un logiciel différent pour gérer les fichiers BED. Vous trouverez ci-dessous un résumé du nombre de programmes prenant en charge et ouvrant le fichier BED sur chaque plate-forme système.

Systèmes d'exploitation
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Qu'est-ce que le fichier BED?

Le fichier avec l'extension BED est le type de fichier Fichiers de données. L'auteur de ce format est UCSC. Fichiers de données se compose de 1326 fichiers similaires. UCSC BED Annotation Track Format est pris en charge par les systèmes d'exploitation 4. Le fichier fonctionnera sur les systèmes Linux, Mac OS, Web, Windows, malheureusement pas sur les autres. Le programme principal qui prend en charge ce format est Integrated Genome Browser. Cela a été créé par UNC Charlotte. Vous pouvez également utiliser 4 d'autres programmes. Les programmes Genome Browser, InfoSnorkel gèrent également le fichier lorsque le programme Integrated Genome Browser ne remplit pas son rôle.

Comment ouvrir le fichier BED?

Le problème le plus courant lors de l'utilisation de UCSC BED Annotation Track Format est qu'un BED spécifique n'est pas associé au programme. Cela provoque l'ouverture du fichier BED par des applications système non conçues à cet effet, ou l'affichage d'un message indiquant qu'il n'y a pas de programme associé. Ce problème peut être facilement résolu.

La première chose à faire est de simplement "double-cliquer" sur l'icône du fichier BED que vous voulez ouvrir. Si le système d'exploitation dispose d'une application appropriée pour le prendre en charge et qu'il existe également une association entre le fichier et le programme, le fichier doit être ouvert.

Étape 1. Installez Integrated Genome Browser

Dans ce cas, vous devez d'abord vérifier que l'application Integrated Genome Browser est installée sur l'ordinateur. Pour ce faire, entrez le nom Integrated Genome Browser dans le moteur de recherche du système. Si ce n'est pas le cas, l'installation peut résoudre le problème, car la plupart des applications créent des associations de fichiers lors de l'installation. Vous trouverez ci-dessous une liste des programmes prenant en charge le fichier BED.

Programmes pour ouvrir le fichier BED

N'oubliez pas de télécharger les programmes prenant en charge les fichiers BED uniquement à partir de sources vérifiées et sûres. Nous vous suggérons d'utiliser les sites Web des développeurs de logiciels.

Étape 2. Créez une association de Integrated Genome Browser avec BED fichiers

Si, malgré l'application installée, le fichier BED ne démarre pas dans l'application Integrated Genome Browser, vous devez créer une association de fichier. Il est plus pratique d'appeler le menu contextuel avec le bouton droit de la souris et de sélectionner Propriétés. La fenêtre affichera, entre autres, le type de fichier et les informations par lesquelles le programme est utilisé pour lancer le fichier. En utilisant le bouton "Modifier", nous pouvons sélectionner le programme souhaité. Le programme doit être visible dans la fenêtre, sinon il doit être sélectionné manuellement à l'aide du bouton "Parcourir" et le répertoire d'installation du programme doit être indiqué. Cependant, il est important de cocher la case "Toujours utiliser le programme sélectionné ...", cela vous permettra d'associer en permanence le fichier BED à l'application Integrated Genome Browser.

Étape 3. Mettez à jour Integrated Genome Browser vers la dernière version

Le problème peut également provenir du programme Integrated Genome Browser, il est possible que UCSC BED Annotation Track Format nécessite une version plus récente du programme. Cela peut être fait en utilisant l'application (si elle fournit de telles options) ou à partir du site Web UNC Charlotte et installez la dernière version.

Étape 4. Recherchez les problèmes suivants avec le fichier BED

Si les étapes ci-dessus ne vous aident pas, vous pouvez supposer que le fichier lui-même n'est pas correct. Les problèmes de fichiers peuvent être divisés comme suit:

Le fichier affecté peut être de 0 Ko ou moins que prévu. Ceci est le plus souvent causé par un problème lors du téléchargement du fichier BED. Le fichier doit être téléchargé à nouveau, en s'assurant que le processus s'est terminé correctement.
Le système d'exploitation est peut-être infecté par un virus informatique. Une analyse antivirus à l'aide d'un programme antivirus à jour devrait résoudre le problème. Certains fournisseurs d'antivirus fournissent également des scanners en ligne gratuits. Pour de meilleurs résultats, nous analyserons l'ensemble du système d'exploitation, pas seulement notre fichier BED. À la suite de l'analyse, il n'est parfois pas possible de récupérer les fichiers BED, qui sont supprimés s'il y a une sauvegarde de ce fichier, puis après la restauration, il doit également être analysé.
Cela peut se produire en particulier lorsque le programme est développé dynamiquement et que la structure des fichiers BED change au fil du temps. Ces problèmes sont connus et sont souvent très faciles à résoudre à l'aide du site Web des développeurs de logiciels.
Il peut y avoir plusieurs raisons à cela. La réparation dépend beaucoup du type de fichier. Certains programmes offrent la possibilité de récupérer des données à partir de fichiers BED endommagés. Le moyen le plus simple est de restaurer le fichier à partir d'une sauvegarde, s'il y en a une, ou de contacter UCSC
Lors de la lecture, un message apparaît indiquant que le fichier a été crypté ou corrompu. Les fichiers BED cryptés peuvent être utilisés par l'appareil sur lequel ils ont été cryptés, sur tout autre appareil, il est nécessaire de disposer de la clé cryptographique appropriée et de décrypter le fichier avant sa récupération.
Le système d'exploitation protège les fichiers à certains endroits (par exemple à la racine de la partition système) contre les accès non autorisés. Bien qu'il n'y ait généralement aucun problème pour lire un tel fichier, il peut ne pas être possible de l'enregistrer. Si possible, vous pouvez essayer de déplacer le fichier BED vers un autre emplacement.
Ce problème se produit uniquement avec des fichiers plus complexes. Certains types de fichiers ne peuvent être ouverts que dans un programme à la fois. La fermeture d'autres programmes devrait aider. Parfois, vous devez attendre la fermeture de la session du fichier BED. Cependant, certains programmes d'arrière-plan peuvent bloquer le fichier BED lors de l'analyse. Si le problème persiste, redémarrez la machine.