Wskazówki dotyczące otwierania pliku BED
Nie możesz otworzyć pliku BED? Nie jesteś jedyny. Tysiące użytkowników codziennie boryka się z podobnymi problemami. Poniżej znajdziesz wskazówki, jak otworzyć pliki BED, a także listę programów, które obsługują pliki BED.
Rozszerzenie pliku BED
| Nazwa pliku |
UCSC BED Annotation Track Format |
| Programista plików |
UCSC |
| Kategoria pliku |
Pliki danych |
Plik BED jest obsługiwany w systemach operacyjnych 4. W zależności od systemu operacyjnego możesz potrzebować innego oprogramowania do obsługi plików BED. Poniżej znajduje się podsumowanie liczby programów, które obsługują i otwierają plik BED na każdej platformie systemowej.
Czym jest plik BED?
Plik o rozszerzeniu BED jest to rodzaj pliku Pliki danych. Autorem tego formatu jest UCSC. Na zawartość Pliki danych składa się 1326 podobnych plików. UCSC BED Annotation Track Format obsługiwany jest przez 4 systemów operacyjnych. Plik zadziała na systemach Linux, Mac OS, Web, Windows, na pozostałych niestety nie. Głównym programem obsługującym ten format jest Integrated Genome Browser. Program ten jest autorstwa UNC Charlotte. Alternatywnie można użyć 4 innych programów. Z plikiem poradzą sobie również programy Genome Browser, InfoSnorkel, gdy program Integrated Genome Browser nie spełni swojej roli.
Jak otworzyć plik BED?
Najczęstszym problemem przy korzystaniu z UCSC BED Annotation Track Format jest brak powiązania konkretnego BED z programem. Powoduje to otwieranie się pliku BED przez aplikacje systemowe nieprzeznaczone do tego celu lub wyświetlenie komunikatu o braku skojarzonego programu. Takiemu problemowi można w miarę prosto zaradzić.
Pierwszą rzeczą, którą powinieneś zrobić, jest po prostu „ podwójne kliknięcie ” na ikonę pliku BED, który chcesz otworzyć. Jeżeli w systemie operacyjnym istnieje odpowiednia aplikacja do jego obsługi i istnieje również powiązanie między plikiem a programem, plik powinien zostać otwarty.
Krok 1. Zainstaluj Integrated Genome Browser
W takiej sytuacji powinno się w pierwszej kolejności zweryfikować czy aplikacja Integrated Genome Browser jest zainstalowana na komputerze. W tym celu należy wprowadzić nazwę Integrated Genome Browser do wyszukiwarki systemowej. Jeżeli jej nie ma instalacja może rozwiązać problem, gdyż większość aplikacji podczas instalacji ustanawia powiązania plików. Poniżej lista programów obsługujących plik BED.
Programy do otwierania pliku BED
Pamiętaj, aby pobierać programy obsługujące pliki BED tylko ze sprawdzonych i bezpiecznych źródeł. Sugerujemy korzystanie ze stron internetowych twórców oprogramowania.
Krok 2. Utwórz powiązanie Integrated Genome Browser z plikami BED
Jeżeli mimo zainstalowanej aplikacji plik BED nie uruchamia się w aplikacji Integrated Genome Browser należy ustanowić powiązanie pliku. Najwygodniej jest wywołać menu kontekstowe prawym klawiszem myszy i wybrać opcję Właściwości. W oknie będzie podany między innymi typ pliku oraz informacja za pomocą jakiego programu jest uruchamiany taki plik. Korzystając z przycisku "Zmień" możemy wybrać pożądany program. Program powinien być widoczny w oknie, w przeciwnym wypadku należy go wskazać ręcznie korzystając z przycisku "Przeglądaj" i wskazać katalog instalacji programu. Ważne natomiast jest zaznaczenie pola "Zawsze używaj wybranego programu..." pozwoli to na stałe powiązać plik BED z aplikacja Integrated Genome Browser.
Krok 3. Zaktualizuj Integrated Genome Browser do najnowszej wersji
Wina może leżeć także po stronie programu Integrated Genome Browser możliwe jest, że UCSC BED Annotation Track Format wymaga nowszej wersji programu. Można to zrobić korzystając z aplikacji (jeżeli udostępnia taką opcje) lub ze strony UNC Charlotte i zainstalować najnowszą wersje.
Krok 4. Sprawdź następujące problemy z plikiem BED
Jeżeli powyższe kroki nie przyniosą rezultatu można uznać iż sam plik nie jest poprawny. Problemy z plikami można podzielić na następujące:
Błędny plik może mieć rozmiar 0 kB lub mniejszy od oczekiwanego. Spowodowane jest to najczęściej problemem przy pobieraniu pliku BED. Plik należy pobrać ponownie upewniając się, że proces dobiegł poprawnie końca.
System operacyjny może być zainfekowany wirusem komputerowym. Skan antywirusowy przy użyciu aktualnego programu antywirusowego powinien rozwiązać problem. Niektórzy producenci antywirusów udostępniają także darmowe skanery online. Najlepszy rezultat odniesie się skanując cały system operacyjny, nie ograniczając się jedynie do naszego pliku BED. W wyniku skanu czasami nie ma możliwości odratowania plików BED, które zostają usunięte jeżeli jest kopia zapasowa tego pliku to po przywróceniu należy ją także przeskanować.
Może się tak wydarzyć zwłaszcza, gdy program jest dynamicznie rozwijany i z czasem zmieniana jest struktura plików BED. Problemy te są znane i często bardzo łatwo je naprawić korzystając ze strony producenta oprogramowania.
Przyczyn takiego stanu może być wiele. Naprawa w duże mierze zależy od typu pliku. Część programów oferuje możliwość odzyskania danych z uszkodzonych plików BED. Najprostszym sposobem jest przywrócenie pliku z kopii zapasowej jeżeli takowa istnieje lub kontakt z UCSC
Podczas odczytu wyświetlany jest komunikat o szyfrowaniu lub uszkodzeniu pliku. Zaszyfrowane pliki BED mogą być wykorzystywane przez urządzenie na którym zostały zaszyfrowane, na każdym innym wymagane jest posiadanie odpowiedniego klucza kryptograficznego i odszyfrowanie pliku przed jego odtworzeniem.
System operacyjny chroni pliki w niektórych lokalizacjach (np. katalog główny partycji systemowej) przed niepowoływanym dostępem. O ile zazwyczaj nie ma problemu z odczytem takiego pliku, to jego zapisanie może okazać się niemożliwe. Jeżeli jest taka możliwość można spróbować przenieść plik BED do innej lokalizacji.
Taki problem występuje tylko na bardziej złożonych plikach. Niektóre typy plików mogą być otworzone w tym samym czasie jedynie w jednym programie. Zamkniecie innych programów powinno pomóc. Niekiedy trzeba odczekać aż sesja do pliku BED się zamknie. Natomiast niektóre programy działające w tle mogą blokować plik BED na czas skanowania. Jeśli nadal problem nie ustąpi pozostaje ponownie uruchomić maszynę.
Czy ta strona była pomocna? takNie
