Tips om BED-bestand te openen

Kunt u het BED-bestand niet openen? Je bent niet de enige. Duizenden gebruikers worden elke dag met soortgelijke problemen geconfronteerd. Hieronder vindt u tips voor het openen van BED-bestanden, evenals een lijst met programma's die BED-bestanden ondersteunen.

BED bestandsextensie

Bestandsnaam UCSC BED Annotation Track Format
Bestandsontwikkelaar UCSC
Bestandscategorie Gegevensbestanden

Het BED-bestand wordt ondersteund op 4-besturingssystemen. Afhankelijk van uw besturingssysteem heeft u mogelijk andere software nodig om de BED-bestanden te verwerken. Hieronder vindt u een samenvatting van het aantal programma's dat het BED-bestand op elk systeemplatform ondersteunt en opent.

Besturingssystemen
  • 2
  • 1
  • 1
  • 0
  • 0
  • 0

Wat is BED-bestand?

Het bestand met de extensie BED is het bestandstype Gegevensbestanden. De auteur van dit formaat is UCSC. Gegevensbestanden bestaat uit 1326 vergelijkbare bestanden. UCSC BED Annotation Track Format wordt ondersteund door 4 besturingssystemen. Het bestand werkt op Linux, Mac OS, Web, Windows-systemen, helaas niet op andere. Het hoofdprogramma dat dit formaat ondersteunt, is Integrated Genome Browser. Dit is gemaakt door UNC Charlotte. U kunt ook 4 andere programma's gebruiken. De Genome Browser, InfoSnorkel-programma's zullen het bestand ook behandelen als het Integrated Genome Browser-programma zijn rol niet vervult.

Hoe een BED-bestand te openen?

Het meest voorkomende probleem bij het gebruik van UCSC BED Annotation Track Format is dat een specifieke BED niet aan het programma is gekoppeld. Hierdoor wordt het bestand BED geopend door systeemtoepassingen die niet voor dit doel zijn ontworpen, of wordt een bericht weergegeven dat er geen bijbehorend programma is. Dit probleem kan eenvoudig worden verholpen.

Het eerste dat u moet doen is "dubbelklikken" op het BED bestandspictogram dat u wilt openen. Als het besturingssysteem een geschikte applicatie heeft om dit te ondersteunen en er is ook een verband tussen het bestand en het programma, dan moet het bestand worden geopend.

Stap 1. Installeer Integrated Genome Browser

In dat geval moet u eerst controleren of de Integrated Genome Browser-toepassing op de computer is geïnstalleerd. Voer hiervoor de naam Integrated Genome Browser in de systeemzoekmachine in. Als dit niet het geval is, kan de installatie het probleem mogelijk oplossen, aangezien de meeste toepassingen tijdens de installatie bestandskoppelingen maken. Hieronder staat een lijst met programma's die het bestand BED ondersteunen.

Programma's om BED-bestand te openen

Vergeet niet om programma's die BED-bestanden ondersteunen alleen te downloaden van geverifieerde en veilige bronnen. We raden aan om de websites van softwareontwikkelaars te gebruiken.

Stap 2. Maak een associatie van Integrated Genome Browser met BED-bestanden

Als, ondanks de geïnstalleerde applicatie, het BED-bestand niet start in de Integrated Genome Browser-applicatie, moet u een bestandsassociatie maken. Het is het gemakkelijkst om het contextmenu met de rechtermuisknop op te roepen en Eigenschappen te selecteren . Het venster toont onder andere het type bestand en de informatie waarmee het programma wordt gebruikt om het bestand te starten. Met de knop "Wijzigen" kunnen we het gewenste programma selecteren. Het programma moet zichtbaar zijn in het venster, anders moet het handmatig worden geselecteerd met de knop "Bladeren" en moet de installatiedirectory van het programma worden aangegeven. Het is echter belangrijk om het vakje "Gebruik altijd het geselecteerde programma ..." aan te vinken , hierdoor kunt u het BED-bestand permanent koppelen aan de Integrated Genome Browser-toepassing.

Stap 3. Werk Integrated Genome Browser bij naar de nieuwste versie

De fout kan ook liggen bij het Integrated Genome Browser programma, het is mogelijk dat UCSC BED Annotation Track Format een nieuwere versie van het programma nodig heeft. Dit kan worden gedaan met behulp van de applicatie (als deze dergelijke opties biedt) of vanaf de UNC Charlotte website en installeer de nieuwste versie.

Stap 4. Controleer op de volgende problemen met het BED-bestand

Als de bovenstaande stappen niet helpen, kunt u ervan uitgaan dat het bestand zelf niet correct is. Bestandsproblemen kunnen als volgt worden onderverdeeld:

Het betrokken bestand is mogelijk 0 KB of kleiner dan verwacht. Dit wordt meestal veroorzaakt door een probleem tijdens het downloaden van het BED-bestand. Het bestand moet opnieuw worden gedownload en zorg ervoor dat het proces correct is voltooid.
Het besturingssysteem is mogelijk geïnfecteerd met een computervirus. Een virusscan met een up-to-date antivirusprogramma zou het probleem moeten oplossen. Sommige leveranciers van antivirusprogramma's bieden ook gratis online scanners. Voor de beste resultaten scannen we het hele besturingssysteem, niet alleen ons BED-bestand. Als resultaat van de scan is het soms niet mogelijk om BED-bestanden te herstellen, die worden verwijderd als er een back-up van dit bestand is, en na het herstellen moet het ook worden gescand.
Dit kan vooral gebeuren wanneer het programma dynamisch wordt ontwikkeld en de structuur van de BED-bestanden in de loop van de tijd verandert. Deze problemen zijn bekend en zijn vaak heel eenvoudig op te lossen via de website van de softwareontwikkelaar.
Hiervoor kunnen veel redenen zijn. Herstellen is erg afhankelijk van het bestandstype. Sommige programma's bieden de mogelijkheid om gegevens te herstellen van beschadigde BED-bestanden. De eenvoudigste manier is om het bestand te herstellen vanaf een back-up, als die er is, of neem contact op met UCSC
Bij het lezen verschijnt een bericht dat het bestand is versleuteld of beschadigd. De gecodeerde BED-bestanden kunnen worden gebruikt door het apparaat waarop ze zijn gecodeerd, op elk ander apparaat is het nodig om de juiste cryptografische sleutel te hebben en het bestand te decoderen voordat het kan worden hersteld.
Het besturingssysteem beschermt bestanden op sommige locaties (bijvoorbeeld de root van de systeempartitie) tegen onbevoegde toegang. Hoewel het meestal geen probleem is om een dergelijk bestand te lezen, is het wellicht niet mogelijk om het op te slaan. Indien mogelijk kunt u proberen het BED-bestand naar een andere locatie te verplaatsen.
Dit probleem treedt alleen op bij complexere bestanden. Sommige bestandstypen kunnen slechts in één programma tegelijk worden geopend. Het sluiten van andere programma's zou moeten helpen. Soms moet je wachten tot de sessie het bestand BED sluit. Sommige achtergrondprogramma's kunnen het BED-bestand echter blokkeren tijdens het scannen. Start de machine opnieuw als het probleem zich blijft voordoen.