Vinkkejä tiedoston FASTA avaamiseen

FASTA-tiedostoa ei voi avata? Et ole ainoa. Tuhannet käyttäjät kohtaavat samanlaisia ongelmia päivittäin. Alla on vinkkejä FASTA-tiedostojen avaamiseen sekä luettelo ohjelmista, jotka tukevat FASTA-tiedostoa.

FASTA-tiedostotunniste

Tiedoston nimi FASTA Sequence Format
Tiedostoluokka Data Files

FASTA-tiedostoa tuetaan 3-käyttöjärjestelmässä. Käyttöjärjestelmäsi mukaan saatat tarvita eri ohjelmistoja FASTA-tiedostojen käsittelemiseen. Alla on yhteenveto ohjelmien määrästä, jotka tukevat ja avaavat FASTA-tiedoston kullakin järjestelmäalustalla.

Käyttöjärjestelmät
  • 5
  • 3
  • 1
  • 0
  • 0
  • 0

Mikä on FASTA-tiedosto?

FASTA-muodossa oleva tiedosto kuuluu Data Files-luokkaan. Lisäksi Data Files-luokka sisältää 1326 muuta tiedostoa. FASTA Sequence Format näkyy 3-käyttöjärjestelmässä toiminnallisena tiedostona. Vaikka se löytyy suuremmalla tai pienemmällä menestyksellä missä tahansa käyttöjärjestelmässä, siitä on hyötyä vain Linux, Mac OS, Windows-käyttöjärjestelmässä. Tärkein ohjelma, joka tukee tätä muotoa, on SnapGene. Tämän loi GSL Biotech. Tämän tiedostotyypin voi avata myös 8 muulla ohjelmalla. DNA Baser, SeqVerter, Geospiza FinchTV, BSEdit-ohjelmat käsittelevät tiedostoa myös silloin, kun SnapGene-ohjelma ei täytä rooliaan.

Kuinka avata FASTA-tiedosto?

FASTA Sequence Format: n kanssa usein toistuva ongelma on, että FASTA ei ole liitetty oikeaan ohjelmatiedostoon. Tämä aiheuttaa tiedoston FASTA avaamisen järjestelmäsovelluksissa, joita ei ole tarkoitettu tähän tarkoitukseen, tai näyttää viestin, että siihen ei ole liitetty ohjelmaa. Tämä ongelma voidaan korjata helposti.

Ensimmäinen asia, jonka sinun pitäisi tehdä, on vain kaksoisnapsauttaa avattavaa FASTA-tiedostokuvaketta. Jos käyttöjärjestelmällä on asianmukainen sovellus sen tukemiseksi ja tiedoston ja ohjelman välillä on myös yhteys, tiedosto on avattava.

Vaihe 1. Asenna SnapGene

Ensimmäinen vaihe on tarkistaa, onko tietokoneessa SnapGene-ohjelma asennettuna. Tätä varten kirjoita nimi SnapGene järjestelmän hakukoneeseen. Jos asianmukaista ohjelmaa ei ole, sen asentaminen valtaosassa tapauksista korjaa ongelman. Alla on luettelo ohjelmista, jotka tukevat tiedostoa FASTA.

Vaihe 2. Luo SnapGene yhdistäminen FASTA-tiedostoon

Jos sovellus on tai on juuri asennettu, mutta FASTA-tiedosto ei vieläkään käytä SnapGene ohjelmaa, se ei tarkoita yhdistämistä. On kätevintä soittaa pikavalikkoon hiiren oikealla painikkeella ja valita Ominaisuudet. Näkyvä ikkuna sisältää tietoja ohjelmasta, joka tukee tämän tyyppisiä tiedostoja. "Muuta" -painiketta käyttämällä voimme asettaa ohjelman käsittelemään tätä tyyppiä. Jos luettelossa ei ole ohjelmistoa, valitse "Selaa" ja valitse manuaalisesti hakemisto, johon sovellus on asennettu. "Käytä aina valittua ohjelmaa ..." -kenttä asettaa SnapGene-sovelluksen oletukseksi FASTA-tiedoston käsittelyyn.

Vaihe 3. Päivitä SnapGene uusimpaan versioon

Jos kuitenkin sen jälkeen, kun SnapGene on sidottu FASTA Sequence Format: ään, on edelleen ongelmia, päivitä ohjelma uusimpaan versioon. Tämä voidaan tehdä sovelluksella (jos se tarjoaa tällaisia vaihtoehtoja) tai GSL Biotech-sivustolta ja asenna uusin versio.

Vaihe 4. Tarkista seuraavat ongelmat FASTA-tiedostossa

Jos yllä olevat vaiheet eivät auta, voit olettaa, että itse tiedosto ei ole oikea. Tämä voi johtua itse tiedostosta, puhtaimmat ongelmat ovat:

FASTA-tiedosto voi olla epätavallisen pieni verrattuna alkuperäiseen tiedostoon. Yleensä tämä koskee # Internetistä ladattuja FASTA-tiedostoa, jos lataus ei onnistunut oikein. Tiedoston lataamisen uudelleen pitäisi korjata ongelma.
Yleisin syy tässä on tietokonevirukset. Ajantasaisella virustentorjuntaohjelmalla suoritettavan virustarkistuksen pitäisi korjata ongelma. Jotkut virustentorjuntatoimittajat tarjoavat myös ilmaisia online-skannereita. On kuitenkin tärkeää tarkistaa koko järjestelmä, ei vain tiedosto FASTA tai ohjelmahakemisto. Muista kuitenkin, että kaikkia tartunnan saaneita FASTA-tiedostoja ei voida palauttaa, joten on tärkeää huolehtia säännöllisistä varmuuskopioista.
Tämä voi tapahtua varsinkin kun ohjelmaa kehitetään dynaamisesti ja FASTA-tiedostojen rakenne muuttuu ajan myötä. Nämä ongelmat ovat tunnettuja ja ne on usein helppo korjata ohjelmistokehittäjien verkkosivuilla.
Epäonnistumiselle voi olla monia syitä. Tiedostotyypistä riippuen se on korjattava vastaavasti. Jotkut ohjelmat tarjoavat mahdollisuuden korjata FASTA-tiedostojen vioittuminen automaattisesti. Helpoin tapa palauttaa tiedosto on varmuuskopiosta tai ottamalla yhteyttä N/A, mutta tämä voi olla kallista. Kaikkia vaurioita ei voida peruuttaa.
Ohjelma voi myös ilmoittaa salauksesta. Salattuja FASTA-tiedostoja ei voi toistaa muilla tietokoneilla kuin sillä, jolla ne on salattu, ne on purettava ennen niiden käyttöä toisella laitteella.
Joitakin järjestelmähakemistoja ei muuteta. Nämä hakemistot ovat kirjoitussuojattuja, ja ongelman korjaaminen on erittäin vaikeaa. On parasta siirtää FASTA toiseen hakemistoon.
Tämä voi tapahtua tiedostossa, joka ei tue monipääsyä. Jotkin tiedostotyypit voidaan avata vain yhdessä ohjelmassa kerrallaan. Käynnissä olevat ohjelmat (myös taustalla olevat) tulisi tarkistaa. Jos virhe jatkuu muiden ohjelmien sulkemisen jälkeen, odota hetki. Jotkin taustaohjelmat voivat kuitenkin estää FASTA-tiedoston skannauksen aikana. Jos tämä ei toimi, käynnistä laite uudelleen.