Wskazówki dotyczące otwierania pliku FASTA

Nie możesz otworzyć pliku FASTA? Nie jesteś jedyny. Tysiące użytkowników codziennie boryka się z podobnymi problemami. Poniżej znajdziesz wskazówki, jak otworzyć pliki FASTA, a także listę programów, które obsługują pliki FASTA.

Rozszerzenie pliku FASTA

Nazwa pliku FASTA Sequence Format
Kategoria pliku Pliki danych

Plik FASTA jest obsługiwany w systemach operacyjnych 3. W zależności od systemu operacyjnego możesz potrzebować innego oprogramowania do obsługi plików FASTA. Poniżej znajduje się podsumowanie liczby programów, które obsługują i otwierają plik FASTA na każdej platformie systemowej.

System operacyjny
  • 5
  • 3
  • 1
  • 0
  • 0
  • 0

Czym jest plik FASTA?

Plik w formacie FASTA należy do kategorii Pliki danych. Dodatkowo kategoria Pliki danych zawiera 1326 innych plików. FASTA Sequence Format występuje na 3 systemów operacyjnych jako plik fukncjonalny. Mimo że można go spotkać z mniejszym lub większym powodzeniem na każdym systemie operacyjnym to użyteczny będzie jedynie na Linux, Mac OS, Windows. Głównym programem obsługującym ten format jest SnapGene. Program ten jest autorstwa GSL Biotech. Ten typ pliku może być również otwarty przez 8 innych programów. Z plikiem poradzą sobie również programy DNA Baser, SeqVerter, Geospiza FinchTV, BSEdit, gdy program SnapGene nie spełni swojej roli.

Jak otworzyć plik FASTA?

Często nawracającym problemem z FASTA Sequence Format jest brak związku FASTA jako pliku z odpowiednim programem. Powoduje to otwieranie się pliku FASTA przez aplikacje systemowe nieprzeznaczone do tego celu lub wyświetlenie komunikatu o braku skojarzonego programu. Takiemu problemowi można w miarę prosto zaradzić.

Pierwszą rzeczą, którą powinieneś zrobić, jest po prostu „ podwójne kliknięcie ” na ikonę pliku FASTA, który chcesz otworzyć. Jeżeli w systemie operacyjnym istnieje odpowiednia aplikacja do jego obsługi i istnieje również powiązanie między plikiem a programem, plik powinien zostać otwarty.

Krok 1. Zainstaluj SnapGene

Pierwszym krokiem jest sprawdzenie czy komputer posiada zainstalowany program SnapGene. W tym celu należy wprowadzić nazwę SnapGene do wyszukiwarki systemowej. Przy braku odpowiedniego programu jego instalacja w znakomitej większości przypadków naprawi problem. Poniżej lista programów obsługujących plik FASTA.

Krok 2. Utwórz powiązanie SnapGene z plikami FASTA

W przypadku, gdy aplikacja jest lub została świeżo zainstalowana, ale plik FASTA dalej nie korzysta z programu SnapGene oznacza to brak powiązania. Najwygodniej jest wywołać menu kontekstowe prawym klawiszem myszy i wybrać opcję Właściwości. Wywołane okienko będzie zawierać informację o tym przez jaki program ten typ pliku jest obsługiwany. Za pomocą przycisku "Zmień" ustawiamy program do obsługi tego typu. W przypadku braku oprogramowania na liście wystarczy wybrać "Przeglądaj" i ręcznie wskazać katalog, gdzie aplikacja jest zainstalowana. Pole "zawsze używaj wybranego programu..." ustawi aplikację SnapGene jako domyślną do obsługi pliku FASTA.

Krok 3. Zaktualizuj SnapGene do najnowszej wersji

Gdyby jednak po powiązaniu SnapGene z FASTA Sequence Format nadal występowały problemy to powinno się zaktualizować program do najnowszej wersji. Można to zrobić korzystając z aplikacji (jeżeli udostępnia taką opcje) lub ze strony GSL Biotech i zainstalować najnowszą wersje.

Krok 4. Sprawdź następujące problemy z plikiem FASTA

Jeżeli powyższe kroki nie przyniosą rezultatu można uznać iż sam plik nie jest poprawny. Może to być spowodowane samym plikiem, najczystsze problemy to:

Plik FASTA może być nietypowo mały w stosunku do oryginalnego. Zazwyczaj tyczy się to plików FASTA pobieranych z Internetu w przypadku kiedy pobranie nie zostało poprawnie zakończone. Ponowne pobranie pliku powinno rozwiązać problem.
Przyczyną są tu najczęściej wirusy komputerowe. Skan antywirusowy przy użyciu aktualnego programu antywirusowego powinien rozwiązać problem. Niektórzy producenci antywirusów udostępniają także darmowe skanery online. Ważne jest natomiast przeprowadzenie skanu całego systemu, a nie tylko pliku FASTA czy katalogu programu. Należy jednak pamiętać iż nie każdy zainfekowany plik FASTA można odzyskać, dlatego ważne jest dbanie o regularne kopie zapasowe.
Może się tak wydarzyć zwłaszcza, gdy program jest dynamicznie rozwijany i z czasem zmieniana jest struktura plików FASTA. Problemy te są znane i często bardzo łatwo je naprawić korzystając ze strony producenta oprogramowania.
Powodów uszkodzenia może być wiele. W zależności od typu pliku należy podjąć się stosownej naprawy. Niektóre programy oferują możliwość automatycznego naprawiania uszkodzeń plików FASTA. Najłatwiej przywrócić plik z kopii albo kontakt z N/A, lecz ten może okazać się kosztowny. Nie każde uszkodzenie można odwrócić.
Program może także sygnalizować fakt szyfrowania. Zaszyfrowane pliki FASTA nie mogą być odtwarzane na innych komputerach niż ten na którym je zaszyfrowano, przed użyciem na innym urządzeniu należy je odszyfrować.
Część katalogów systemowych jest wyłączona z możliwości modyfikacji. Katalogi te są chronione przed zapisem do nich i bardzo ciężko rozwiązać ten problem. Najlepiej jest przenieść plik FASTA do innego katalogu.
Może zdarzyć się to na pliku nie obsługującym wielokrotnego dostępu. Niektóre typy plików mogą być otworzone w tym samym czasie jedynie w jednym programie. Należy zweryfikować uruchomione programy (także te w tle). Jeżeli błąd nie ustąpi po zamknięciu innych programów należy odczekać chwilę. Natomiast niektóre programy działające w tle mogą blokować plik FASTA na czas skanowania. Jeżeli i to nie odniesie rezultatu, zrestartuj urządzenie.