Wskazówki dotyczące otwierania pliku FASTQ

Nie możesz otworzyć pliku FASTQ? Nie jesteś jedyny. Tysiące użytkowników codziennie boryka się z podobnymi problemami. Poniżej znajdziesz wskazówki, jak otworzyć pliki FASTQ, a także listę programów, które obsługują pliki FASTQ.

Rozszerzenie pliku FASTQ

Nazwa pliku FASTQ Format
Kategoria pliku Różne pliki

Plik FASTQ jest obsługiwany w systemach operacyjnych 3. W zależności od systemu operacyjnego możesz potrzebować innego oprogramowania do obsługi plików FASTQ. Poniżej znajduje się podsumowanie liczby programów, które obsługują i otwierają plik FASTQ na każdej platformie systemowej.

System operacyjny
  • 5
  • 2
  • 2
  • 0
  • 0
  • 0

Czym jest plik FASTQ?

Plik w formacie FASTQ należy do kategorii Różne pliki. Dodatkowo kategoria Różne pliki zawiera 6033 innych plików. FASTQ Format występuje na 3 systemów operacyjnych jako plik fukncjonalny. Plik zadziała na systemach Linux, Mac OS, Windows, na pozostałych niestety nie. Do otwarcia pliku zalecana jest aplikacja Sublime Text. Została ona wydana przez Sublime HQ Pty Ltd. Alternatywnie można użyć 8 innych programów. Można skorzystać z ChromasPro, PSPad, NotePad++ text editor, Atom w przypadku kiedy program Sublime Text nie może zostać użyty.

Jak otworzyć plik FASTQ?

Najczęstszym problemem przy korzystaniu z FASTQ Format jest brak powiązania konkretnego FASTQ z programem. Przez to po otwarciu FASTQ uruchamia się kreator wyboru programu lub jakiś inny program. Jak rozwiązać taki problem?

Pierwszą rzeczą, którą powinieneś zrobić, jest po prostu „ podwójne kliknięcie ” na ikonę pliku FASTQ, który chcesz otworzyć. Jeżeli w systemie operacyjnym istnieje odpowiednia aplikacja do jego obsługi i istnieje również powiązanie między plikiem a programem, plik powinien zostać otwarty.

Krok 1. Zainstaluj Sublime Text

Pierwszym krokiem jest sprawdzenie czy komputer posiada zainstalowany program Sublime Text. Najprostszą metodą będzie skorzystanie z wyszukiwarki systemowej wpisując w niej nazwę programu Sublime Text. Przy braku odpowiedniego programu jego instalacja w znakomitej większości przypadków naprawi problem. W dalszej części artykułu znajdziesz listę programów, które potrafią otworzyć pliki FASTQ.

Krok 2. Utwórz powiązanie Sublime Text z plikami FASTQ

W przypadku, gdy aplikacja jest lub została świeżo zainstalowana, ale plik FASTQ dalej nie korzysta z programu Sublime Text oznacza to brak powiązania. Najwygodniej jest wywołać menu kontekstowe prawym klawiszem myszy i wybrać opcję Właściwości. W oknie będzie podany między innymi typ pliku oraz informacja za pomocą jakiego programu jest uruchamiany taki plik. Zmiany można dokonać korzystając z przycisku "Zmień". W przypadku braku oprogramowania na liście wystarczy wybrać "Przeglądaj" i ręcznie wskazać katalog, gdzie aplikacja jest zainstalowana. Zaznaczenie pola "Zawsze używaj wybranego programu..." na stałe powiąże plik FASTQ z programem Sublime Text.

Krok 3. Zaktualizuj Sublime Text do najnowszej wersji

Wina może leżeć także po stronie programu Sublime Text możliwe jest, że FASTQ Format wymaga nowszej wersji programu. W takim przypadku należy skorzystać ze strony internetowej Sublime HQ Pty Ltd lub zaktualizować program z poziomu aplikacji.

Krok 4. Sprawdź następujące problemy z plikiem FASTQ

Oczywiście może się zdarzyć, że pomimo powyższych kroków plik dalej nie działa. Może to być spowodowane samym plikiem, najczystsze problemy to:

Błędny plik może mieć rozmiar 0 kB lub mniejszy od oczekiwanego. Spowodowane jest to najczęściej problemem przy pobieraniu pliku FASTQ. Ponowne pobranie pliku powinno rozwiązać problem.
Komputer mógł paść ofiarą wirusa komputerowego lub hakera. Szybki skan antywirusowy przy użyciu aktualnego programu antywirusowego powinien rozwiać wątpliwości. Niektórzy producenci antywirusów udostępniają także darmowe skanery online. Skan powinien dotyczyć całego komputera, nie jedynie pliku FASTQ który chcemy otworzyć. W wyniku skanu czasami nie ma możliwości odratowania plików FASTQ, które zostają usunięte jeżeli jest kopia zapasowa tego pliku to po przywróceniu należy ją także przeskanować.
Może się tak wydarzyć zwłaszcza, gdy program jest dynamicznie rozwijany i z czasem zmieniana jest struktura plików FASTQ. Pomocy należy szukać u producenta oprogramowania, gdyż zazwyczaj zalecają oni skorzystanie z darmowych konwerterów plików bądź instalacje starszej wersji programu.
Plik może być uszkodzony w różny sposób. Sposób naprawy trzeba dostosować do rodzaju pliku i uszkodzenia. Czasami sam program posiada opcje naprawy najpopularniejszych uszkodzeń pliku FASTQ. Najłatwiej przywrócić plik z kopii albo kontakt z , lecz ten może okazać się kosztowny. Nie każde uszkodzenie można odwrócić.
Program może także sygnalizować fakt szyfrowania. Zaszyfrowane pliki FASTQ mogą być wykorzystywane przez urządzenie na którym zostały zaszyfrowane, na każdym innym wymagane jest posiadanie odpowiedniego klucza kryptograficznego i odszyfrowanie pliku przed jego odtworzeniem.
Część katalogów systemowych jest wyłączona z możliwości modyfikacji. Katalogi te są chronione przed zapisem do nich i bardzo ciężko rozwiązać ten problem. Najlepiej jest przenieść plik FASTQ do innego katalogu.
Problem ten zazwyczaj dotyczy bardziej złożonych plików. Może okazać się, że inny używany przez użytkownika program uniemożliwia prace z wykorzystaniem tego pliku. Należy zweryfikować uruchomione programy (także te w tle). Jeżeli błąd nie ustąpi po zamknięciu innych programów należy odczekać chwilę. Natomiast niektóre programy działające w tle mogą blokować plik FASTQ na czas skanowania. Jeżeli nic nie pomaga należy zresetować urządzenie.